目前中國的水處理面臨三大問題：
一、水質(zhì)標準互不協(xié)調(diào)
目前大多數(shù)環(huán)保部門根據(jù)《水十條》的要求治水，以為污水處理后排放的水達到一級A就萬事大吉了。殊不知，環(huán)保部一級A的排放標準尚不及水利部關(guān)于水源水質(zhì)要求的五類水標準。
國家規(guī)定，飲用水的水源必須優(yōu)于三類水。
設(shè)計標準的人當時可能以為，接納排放水的河流與飲用水的水源地是互不相干的，實際情況并非如此。比如福建的九龍江，上游污水廠處理后排放的水，會成為下游自來水廠的水源。同一個水體，上游污水處理廠如果僅以一級A為標準，必然不可能把影響人體健康的化學微污染物完全去除，而下游自來水廠又沒有去除化學微污染的凈水工藝，由此導致飲用水安全無法得到保障，結(jié)果必然是老百姓遭殃。
二、污水處理末梢把關(guān)
水污染通常源于人類的生產(chǎn)生活活動，主要包含如下三個方面：1) 生活污染：在居民生活中產(chǎn)生的污染物造成的水污染, 如含磷洗衣粉的污染;2) 工業(yè)污染：在工業(yè)生產(chǎn)中產(chǎn)生的污染物造成水污染, 如造紙廠、采礦場排出的有毒廢水;3) 農(nóng)業(yè)污染：農(nóng)業(yè)生產(chǎn)過程造成的水污染，如種植業(yè)使用農(nóng)藥、化肥，養(yǎng)殖業(yè)使用激素、抗生素等。
目前地方政府部門把所有的壓力都傳導給轄區(qū)所在的污水處理廠，指望由其末梢把關(guān)、達標排放。實際上，目前污水處理廠普遍采用的工藝均無法應(yīng)對復雜的進水條件。舉個例子，許多非理工背景的地方官員以為只要進水的COD、BOD符合規(guī)定，污水處理廠的出水就必然合格。但他們有所不知，許多工業(yè)園區(qū)排放到市政管網(wǎng)中的污水，由于碳氮比嚴重失調(diào)，結(jié)果污水處理廠無法處理，雙方互相指責，引發(fā)許多糾紛。
三、飲水安全指望水廠
隨著人民生活水平的不斷提高，老百姓對飲用水的要求越來越高。各級政府也把提升飲用水質(zhì)、保障飲水安全列入政府的工作計劃與財政預(yù)算。因此，不時會看到一些地方政府發(fā)布公告，耗費巨資升級改造自來水廠。地方政府的本意與愿望是良好的，值得肯定。然而，實際的效果卻值得商榷，因為影響自來水水質(zhì)的因素跟水源水質(zhì)、制水工藝、輸水管網(wǎng)、高樓水箱等密切有關(guān)。
就水源水質(zhì)而言，目前的主要問題是或多或少都遭遇了化學微污染，傳統(tǒng)的四步法凈水工藝對此無能為力，但即使采用先進的超濾膜工藝加以提升改造，也僅僅是在改善澄清度與去除微生物方面卓有成效，而對于水源水質(zhì)中可能含有的化學微污染束手無策。進一步地說，即使水廠出水達標，經(jīng)過參差不齊的輸水管網(wǎng)、管理欠佳的高樓水箱，到了居家住戶的水龍頭，自來水的安全性已經(jīng)無法保障了。
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